Master Magistrate suit l’histoire de Shimei, un nouveau magistrat de Nakamachi. Le travail de Shinmei en tant que magistrat comprend les fonctions de détective, avocat, jury et juge. Pour l’aider à faire respecter la loi et à Nakamachi, deux de ses amis le suivent au bureau: son ami d’enfance garçon manqué, Rimu, et son rival acharné, Sakura. Il peut également dépendre de l’aide des Shinsengumi, y compris de leur magnifique vice-commandant Yamanami et de la puissante épéiste Okita. Le gameplay de Master Magistrate est divisé en trois sections. En contrôlant Shinmei, le joueur pourra se promener dans les bureaux et les villes, interagir avec divers personnages et approfondir leurs relations ensemble, jusqu’à ce qu’ils reçoivent une nouvelle affaire. C’est à ce moment que l’enquête commence, où le joueur devra ensuite collecter des indices de divers personnages et zones en enquêtant sur des objets sur la scène du crime. Une fois que Shinmei aura une bonne idée de ce qui s’est passé, le procès commencera. Le joueur doit contre-interroger plusieurs témoins tout en offrant des preuves jusqu’à ce qu’ils découvrent la vérité. Il n’y a aucune pénalité pour les erreurs et aucun moyen de perdre le jeu, mais les bonnes performances sont récompensées par l’accès à du contenu d’histoire supplémentaire. Master Magistrate a récemment stoppé l’accès anticipé pour sortir en live. Le jeu propose 150 CG d’événement dans différents styles artistiques, une bande-son instrumentale de plus de quarante chansons, environ vingt heures de contenu d’histoire et un jeu de voix professionnelles japonaises complète.